Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Atg5Q99J83 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms