Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec3Q99J72 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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