Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ctu1Q99J10 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ctu1Q99J10 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ctu1Q99J10 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ctu1Q99J10 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms