Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hps3Q91VB4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms