Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms