Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

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Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt79Q8VED5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Krt79Q8VED5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms