Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8VDP2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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