Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc6a20aQ8VDB9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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