Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ubxn4Q8VCH8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ubxn4Q8VCH8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ubxn4Q8VCH8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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