Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BbxQ8VBW5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BbxQ8VBW5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms