Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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