Protein–RNA interactions for Protein: Q8R317

Ubqln1, Ubiquilin-1, mousemouse

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln1Q8R317 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ubqln1Q8R317 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubqln1Q8R317 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubqln1Q8R317 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubqln1Q8R317 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubqln1Q8R317 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubqln1Q8R317 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubqln1Q8R317 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubqln1Q8R317 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubqln1Q8R317 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ubqln1Q8R317 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ubqln1Q8R317 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubqln1Q8R317 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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