Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

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Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tbc1d23Q8K0F1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tbc1d23Q8K0F1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tbc1d23Q8K0F1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tbc1d23Q8K0F1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Tbc1d23Q8K0F1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tbc1d23Q8K0F1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tbc1d23Q8K0F1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tbc1d23Q8K0F1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tbc1d23Q8K0F1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tbc1d23Q8K0F1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbc1d23Q8K0F1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms