Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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