Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc178Q8CDV0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms