Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SynpoQ8CC35 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SynpoQ8CC35 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms