Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccdc187Q8C5V8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccdc187Q8C5V8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc187Q8C5V8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc187Q8C5V8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc187Q8C5V8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc187Q8C5V8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ccdc187Q8C5V8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc187Q8C5V8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ccdc187Q8C5V8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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