Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek11Q8C0Q4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms