Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Atg16l1Q8C0J2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Atg16l1Q8C0J2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Atg16l1Q8C0J2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg16l1Q8C0J2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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