Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim35Q8C006 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms