Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trerf1Q8BXJ2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trerf1Q8BXJ2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trerf1Q8BXJ2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trerf1Q8BXJ2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trerf1Q8BXJ2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trerf1Q8BXJ2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trerf1Q8BXJ2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trerf1Q8BXJ2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trerf1Q8BXJ2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trerf1Q8BXJ2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trerf1Q8BXJ2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trerf1Q8BXJ2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trerf1Q8BXJ2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trerf1Q8BXJ2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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