Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Snx17Q8BVL3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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