Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rd3Q8BRE0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rd3Q8BRE0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rd3Q8BRE0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rd3Q8BRE0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rd3Q8BRE0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rd3Q8BRE0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rd3Q8BRE0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rd3Q8BRE0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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