Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pum3Q8BKS9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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