Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nop53Q8BK35 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nop53Q8BK35 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop53Q8BK35 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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