Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Htatsf1Q8BGC0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Htatsf1Q8BGC0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Htatsf1Q8BGC0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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