Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms