Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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H2-M10.4Q85ZW8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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H2-M10.4Q85ZW8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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H2-M10.4Q85ZW8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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H2-M10.4Q85ZW8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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H2-M10.4Q85ZW8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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H2-M10.4Q85ZW8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M10.4Q85ZW8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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