Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Smim19Q80ZU4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Smim19Q80ZU4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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