Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn34b3Q80ZS5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn34b3Q80ZS5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn34b3Q80ZS5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn34b3Q80ZS5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn34b3Q80ZS5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Cldn34b3Q80ZS5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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