Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pnma8aQ80VM8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms