Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
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