Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rexo1Q7TT28 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rexo1Q7TT28 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo1Q7TT28 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms