Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2q1Q7TSS2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms