Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms