Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sbno2Q7TNB8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms