Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Shq1Q7TMX5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shq1Q7TMX5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms