Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snd1Q78PY7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snd1Q78PY7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms