Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Eci3Q78JN3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms