Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1cQ76I25 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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