Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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