Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zbtb39Q6PDK0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb39Q6PDK0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms