Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp49Q6P9L4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp49Q6P9L4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp49Q6P9L4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp49Q6P9L4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp49Q6P9L4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp49Q6P9L4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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