Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Jmjd1cQ69ZK6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Jmjd1cQ69ZK6 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Jmjd1cQ69ZK6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Jmjd1cQ69ZK6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Jmjd1cQ69ZK6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Jmjd1cQ69ZK6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Jmjd1cQ69ZK6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Jmjd1cQ69ZK6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Jmjd1cQ69ZK6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Jmjd1cQ69ZK6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Jmjd1cQ69ZK6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Jmjd1cQ69ZK6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Jmjd1cQ69ZK6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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