Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Msl2Q69ZF8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms