Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sbno1Q689Z5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms