Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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