Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
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