Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms