Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpd52Q62393 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms